Храм в честь Сретения Господа нашего Иисуса Христа при Костромской духовной семинарии был устроен в 1878 году по благословению епископа Костромского и Галичского Игнатия на средства духовно-учебного капитала в верхнем этаже общежительного семинарского корпуса. В настоящее время в помещении Сретенской церкви размещается концертный зал музыкально-педагогического факультета Костромского государственного университета, занимающего исторические здания Костромской духовной семинарии.

В 2010 году архиепископ Костромской и Галичский Алексий освятил новый храм в трапезном корпусе Богоявленско-Анастасиина женского монастыря города Костромы (Здание духовной семинарии).

В летний период 2013 в храме проводились работы по обновлению и благоустройству храма. 24 ноября состоялась первая Божественная литургия в обновленном домовом храме Костромской духовной семинарии.

Храм является центром духовной жизни семинарии. Здесь студентами совершается утреннее и вечернее молитвенное правило, регулярные богослужения, во время которых семинаристы проходят практику в качестве алтарников, чтецов, певчих и уставщиков.

Помещение Сретенского храма также используется в общецерковных целях. В частности, 30 января 2014 года в храме Сретения Господня Костромской духовной семинарии проходил расширенный Епархиальный Совет.